Havovervågningsprogrammet er en del af Danmarks Havstrategi, og skal sikre indsamling af relevant data til vurdering af de danske farvandes miljømæssige tilstand. Overordnet består Havstrategien af tre dele; en basisanalyse, et overvågningsprogram og et indsatsprogram.
Havstrategien blev indført på baggrund af EU's Havstrategidirektiv med det formål at beskytte de marine økosystemer og sikre, at havets ressourcer bruges bæredygtigt.
EU’s Havstrategidirektiv anskuer de marine økosystemer holistisk. Det betyder, at alle plante- og dyrearter, og deres interaktioner med hinanden og deres omgivelser, ses som en helhed med betydning for havets overordnede tilstand.
Havovervågningsprogrammet indeholder 11 konkrete Deskriptorer, der danner grundlag for vurderingen af havets miljøtilstand.